“晋陕总督臣杨乔然谨奏，请设甘肃承宣布政使司、提刑按察使司事：
自古以来，事易则时移。陇地，北控漠北、漠西，统御蒙古；南可逐鹿中原，成就王霸之基。实军事要地，不可不操纵我手，以制天下。故太祖高皇帝设陕西行都司以御之。两百年来，都司卫所各安其职，西北边陲，有泰山之安。
然天道无常，世事沧桑。卫所武官世代相袭，至今已不堪战；又多有仗权倚势，侵吞私田者。太祖、成祖时之军田，十不存三，国家赋税，流于私人。汉回蒙藏之豪族，各有族兵，私征租税，往往高于国赋数倍。更有甚者，私设公堂，严刑催租，视国法如无物。甘肃民谚云，‘赋税无准则，土地无清册’。长此以往，汉恒灵之祸不远矣！
夫天下者，陛下之家也。内外臣工能明职守、尽本分，便为奠家之磐石；若顾身家以保一官，言善不言恶，愧心馁气，昧没本心，以谀陛下，便为毁家之虫豸也。臣本粗鄙之才，蒙隆下拔擢，受恩深重，不敢不言。
今请于甘肃之地，单独置承宣布政使司、提刑按察使司，设肃州、甘州、永昌、凉州、西宁、庄浪、临洮七府之地，下设州县，各任官佐，重编鱼鳞图册，厘清人口赋税。如此，方为长治久安之道。
此疏一上，必得罪尽甘肃豪族，引物议之汹汹。然臣只知有君，不知有祸，既不忧馋，亦不畏讥。天地昭昭，可鉴臣心。陛下盖世之英主，必能解臣之苦心。
单独设两司，实甘肃第一事也。伏惟陛下恩准，百姓幸甚，国家幸甚。微末浅言，谨具奏闻”。
看了杨乔然上的这道疏，朱亨嘉感慨不已。这位不愧是敢和权臣裂衣打架的直臣，敢言别的大臣不愿言、不敢言之事！甘肃为什么一直动荡不稳？说到底还是各族豪强势力太大，他们大多是世袭的卫所武官，侵吞卫所军田，以朝廷的名义横征暴敛，导致国家的税征不上来，百姓的负担反而加重了。这一点甘肃的文武官员心知肚明，可除了杨乔然，竟无一人敢言。
看到那句“陛下盖世之英主，必能解臣之苦心”，光武帝哑然失笑，杨乔然啊杨乔然，就冲这“盖世之英主”五个字，朕也只有同意了。
想了想，大明刚刚收复了甘肃，正是武威最盛的时候，倒是在甘肃设省、清查土地人口赋税、打压地方豪族的好机会。
当即大笔一挥，批复道：“览尔所言，公忠体国，朕心甚慰。此事利国利民，只管放手为去，纵使惹了祸，朕替汝担着”。
又一想，杨乔然想将陕西临洮府也列入甘肃三司的管辖，陇地贫瘠，临洮划给甘肃，倒是能解决甘肃的财政问题。不过，甘肃面临着蒙古人、回部的威胁，甘肃巡抚驻于临洮府兰州，离边境有些远。不太好，得让他往北移，离边境近些，这样才能更加重视边防。又批道：“朕意，将甘肃巡抚衙门，移至甘州”。
要想派官员清查甘肃豪强隐藏的土地人口，不让这些人乱征税、私设公堂，必然会引起这些豪强的反弹。这些人，手上都有私兵。不行，得把他们的兵调走，改革的阻力才会小。嗯，他们都有军职，大多编在凉州总兵马宁的麾下，得把马宁调得远远的。又下旨令马宁部至北直隶助战。
甘肃提督李成爵是员虎将，有他镇着甘肃，可保万全。这李成爵跟随自己的日子久了，属于老资历的大将。自己让其独领一军去甘肃，也是有让其立功封爵意思。此次，他打下了甘肃，该封爵了。再下旨，封李成爵为西宁伯，部下将领俱有封赏。一时间，军心大悦。
最后，便是挑选甘肃承宣布政使、提刑按察使、巡按御史的人选了。
巡按御史，朱亨嘉想到了翰林学士吴伟业。此人才华横溢，在劝降吴三桂的过程中，立有大功，当即便委了吴伟业此职。
至于布政使和按察使嘛，和重臣们一商量，觉得得挑熟悉甘肃民情的陕西官员。挑来挑去，选了原陕西布政使司参议田厥茂为甘肃布政使、原西安知府叶承祧为甘肃按察使。这两位都是清廷降官，官声很好，没做过什么坏事。归明后还升了官，运气可以说相当的好。
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“甘肃巡抚臣程源谨奏，为在甘肃复开茶马司事：
茶马互市，自古有之。盖番人嗜乳酪，不得茶，则困以病。故唐、宋以来，行以茶易马法，用制羌戎，强中国。
我太祖高皇帝，扫清六合、廓清宇内，奄有天下，皆因仁也。曾云’有回回商人在往来买卖中，如过关津渡口，不许阻滞‘，又云’今天下太平，四海一家，各族商旅往来者，悉听其便；今陇答卫番人来洮贸易，亦听其便‘。洪武五年，设秦州（甘肃天水）茶马司；七年，设河州（甘肃临夏）茶马司；其后，又设洮州（甘肃临潭）茶马司。互通有无，民无物用匮乏之忧，汉夷皆悦之。
然二十年来，甘肃战乱，商路断绝，茶马市亦中断。臣以为，茶马互市，其利有五：一则增朝廷之商税；二则得强壮之战马；三则安甘肃之民心；四则少边关之战祸，五则探胡酋之虚实。
陇地贫瘠，若以茶马互市之利，增补朝廷日用不足，利国利民，善莫大焉。故请于秦州、河州、洮州故地，重设茶马司。微末愚识，静候圣裁”。
朱亨嘉一见这道奏疏，不由得笑了。这个甘肃巡抚程源倒是个财迷，刚上任便想广开财源，解决甘肃的财政问题。他没说错，重开茶马市，的确好处很多。不过气魄有些小，这么大一个甘肃，才三个茶马司怎么够？
一挥大笔，批复答：“尔此言甚善，准了。然三个有些少，朕意除秦、河、洮三州外，再增设肃州嘉峪关茶马司、永昌镇番茶马司”。
又一想，这茶马市不单只是交易茶和马两种商品，其他商品均可交易，因此，茶马司这个字，有些过时。下旨，改茶马司为陆关司。中央为陆关司，各地为陆关分司，与海关司，海关分司对应，皆归户部管辖。