9月4日凌晨，重庆市区内枪声响成一片。反正的第二师第二团，抽调了一个营的兵力由第二师副师长林斌亲自率领，对市长官邸发起了攻击。同时，第二团剩下的部队，对重庆郊外的叛军发起了攻击。里应外合之下，城外的川西军三个师的兵力不费吹灰之力就攻入了重庆市区内。
叛军在这种情况之下，根本就无法和川西军抗衡。最终，除了极少数人被打死之外，剩余的人投降。因为在进攻的时候，川西军没有动用重武器，因此对普通百姓的伤害也是微乎其微。
不过，市长官邸处的战斗，则比较激烈。市长官邸的卫队和守卫这里的第二师警卫连，都算得上是刘文龙和刘祥叔侄的心腹。他们依托市长官邸的建筑，架设了重机枪和迫击炮等，和反正的第二师第二团的一个营顽抗。
不过，战斗了几个小时之后，这些叛军都被消灭了。重庆市市长刘文龙，也被抓住了。在川西军抓捕他的时候，他已经得知了刘祥被杀死在卧室内的消息。他想要自杀，但是却被川西军的士兵们给救了下来。他们叔侄既然胆敢发动叛乱，那么，就得接受川西的惩罚。刘祥是死在川西的特种部队手里的，而刘文龙，则需要被带到成都，接受公正的审判。当然，叛国罪在川西，同样是死罪！
叛乱被平息之后，重庆的民众无不拍手称快。川西军也仅仅只用了十分微小的代价，就得以解决了叛军。最后统计的数据，在重庆伤亡的士兵和百姓，还没有叛军进攻齐江时候的损失大。当然，第二师的损失，则是没有被计算在内的。
随后，第二师剩余的几千残兵，也被解除了武装。他们参与了叛乱，给川西和王毓泽本人，造成了严重的损失。至于如何处置，则需要等候王毓泽的决定了。
9月7日，刘文龙以及他们叔侄的家人，都被押解到了成都。虽然，罪不及家人，但刘家那些参与了叛乱的人，同样需要接受审判。如果情节严重的，照样会按照川西的法律处置。至于那些没有参与叛乱的人，也会统一安置他们的生活。从今往后，他们估计就得生活在川西的监视当中了。毕竟，王毓泽和不会放心他们，万一这些人再搞事，或者干脆来刺杀他或者川西的要员的话，那可就不好收场了。
9月8日上午，在巡阅使府外的广场上，举行了对刘文龙的公开审判。刘祥已经死了，就不在审判之列。上万成都民众，旁听了这一次的审判。当法官最后裁决，以叛国罪判处刘文龙死刑，即刻执行之后，旁听的民众，都发出了欢呼声。在他们的眼中，刘文龙就是一个该死的反贼。现在川西能够有今天，完全是大帅的功劳。大帅刚刚去世，刘文龙叔侄就敢跳出来发动叛乱，简直是罪该万死啊！以至于下午刘文龙在被枪决前的游街的时候，被愤怒的民众用石块等，砸的头破血流，奄奄一息的。而那些警卫们，也没有阻止。他们同样对刘文龙恨之入骨，巴不得他被打死。
刘文龙被枪决，意味着这一次叛乱的主犯已经被处死，叛乱也基本平息了。接下来，则是对从犯的审判，以及对叛乱的第二师的处置问题了。前面一个问题非常好解决，交给法院去就可以了。但是第二师如何处置，这个就有些分歧了。
“大帅！第二师第二团虽然参加了叛乱，但他们并未对我们川西军进行攻击，也没有伤害无辜的百姓。并且最后还是因为他们反正，才使得叛乱很快被平息的。因此，我觉得第二团可以保留，并且以第二团为主，重建第二师！”熊武发表了自己的意见。
“我倒是认为，第二师的所有士兵，那些叛乱的士兵，将按照情节的轻重，进行军法处置。至于第二团，则可以安排他们全部复员。谁也不敢保证，这样的事还会不会发生！”国防部长蒋兴国，发布了自己的意见。
“我们可以让军情局介入，尽量的把那些参与叛乱，并且不是被蛊惑的士兵和军官挖出来，剩余的士兵，则保留下来。我们必须充分的考虑到。以现在的形势，如果强迫第二师的全部官兵都复员的话，会产生多么大的动荡。这无疑会让他们失去希望，到时候如果再发生乱子的话，就很难处理了！”熊武解释道。经过川西的宣传，全体人民都知道了这件事。很多有亲属在第二师服役的百姓，都被骂的抬不起头来。如果在发生强制第二师的士兵复员的事，很可能会引起社会的动荡的。
王毓泽皱起了眉头，如果真是这样的话，倒不是他希望看到的。
“这样吧！让军情局介入，对第二师的官兵进行仔细的甄别，罪行严重的，直接上军事法庭。罪行比较轻的，则强制复员。剩余的人，再补充足够的新兵，打散安排，重建第二师！”王毓泽说道。
“是，大帅！”王毓泽开口了，其他人自然也不会再争论了。
“另外，针对这一次的叛乱，我发现了一个问题。那就是我们的军队体质的僵硬。为什么士兵们这么容易受到刘祥的蛊惑呢？一方面，士兵们普遍的文化程度都不高，不明白事理大义，不知道他们真正效忠的是谁。另外一方面，则是士兵们的观念的培养还不完善。因此，我提议在军队中增设文化教员一职，负责对士兵们进行精神文化方面的教育，要让他们知道，他们效忠的是谁，不是他们的师长或者旅长，而是川西。这样的话，下一次如果再发生这样的事，那些普通士兵们还会受到蛊惑吗？”王毓泽说道。
这种制度，完全就类似于后世的政治委员制度，可以让王毓泽更加的容易掌控军队。即便将领们想要叛乱，但下面的人不听他的，他也就没有办法了。
“大帅，这个办法倒是好。不过，猛然要执行的话，我们需要补充大量的文化教员啊！以川西军现在的规模来看，数量缺口比较大啊！”熊武说道。
“大帅，文化教员主要配置在哪一级？军衔又该如何设置呢？”蒋兴国也问道。国防部成立之后，军队的编制问题，已经划归国防部这边负责了。
“文化教员，只需要设置到连和营一级就行了。连一级的文化教员，军衔为副连级。营一级的文化教员，军衔为副营级。这些文化教员的主要任务，则是教导士兵们识字，明理。同时，要让士兵们知道效忠的对象，这一点尤为重要。还有就是培养士兵们打仗不怕牺牲等勇敢作战的观念等等。至于缺口，可以在川西各大院校里面择优录取。相信有很多的有志青年，都愿意从军的！”王毓泽说道。当然，他没有明说，这些文化教员们最重要的任务，则是要教导士兵们要效忠于他了。每一次文化教员在上课的时候，反复这样提起的话，自然会在士兵们的心里形成一个根深蒂固的观念。这样的话，叛乱之类的事，应该就再也不会发生了。
熊武、蔡云和蒋兴国等人都点了点头，他们都知道这样执行的好处。这样的话，将提高士兵们对川西，对王毓泽本人的效忠。也将有利于对军队的掌控，避免类似的叛乱事件的再发生。
接下来的日子，川西的主流报纸，连篇累牍的介绍川西的叛乱已经被平息了，并且没有造成严重的人员伤亡，同时，为大部分的第二师的士兵们平反，表明他们只不过是被那些野心家迷惑了而已。同时，号召民众要团结起来，效忠王毓泽，效忠川西，为川西的富强而奋斗。
对于川西如此迅速的就平息了叛乱，也有人感到非常的不爽。满清、英法俄日四国，无一不是对这一次的叛乱抱有很大的期望的。结果，短短三天的时间，叛乱就被平息了，给川西造成的损失更是微乎其微，这让他们大为不满。但是却没有办法，这件事本来就是他们暗中做的，如果在明面上表现出来的话，他们还生怕川西会因此而找他们的麻烦。
第二师的士兵们的甄别工作也进行的非常顺利，在军情局的介入之下，很多有罪的士兵和军官们，都受的了应有的惩罚。随后，在参谋本部的支持之下，第二师进行了重建。第二师师长，也有林斌担任，军衔也晋升为了少将。林斌这个人，还是有一定的能力的。只不过刘祥更加强悍，在刘祥的压制之下，他才没有发挥作用的。第二师的中下级军官，则全部由教导师和陆军学院调配，确保这只部队不会才出现类似的事件。
川西大规模的实行文化教员制度，在每一个连和营，都配置了文化教员，不仅仅提高了士兵们的文化，更加让他们树立了对大帅，对川西效忠的观念，进一步的杜绝了出现叛乱的可能。
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