宽永六年（公元1629年），后水尾天皇再度向幕府提出退位请求，而家光果决就此作了决策。
“连续两名皇子都意外薨逝，看来让皇长女继位是天命所趋，这样的话天皇是否在位也并没那么重要了。”
在本丸执政区——表的议事堂里，他这样对土井、酒井、正胜和信纲四名重臣说。
“与其纵容一个任性骄纵的天皇，当然是扶持流着德川氏血脉的皇长女继位要来得契合幕府利益，所以让他如愿地退位吧。”
朝廷本以为天皇再度提出退位必将遭遇幕府阻力而一波三折，但在家光的强硬态度下，幕府未作任何挽留便同意了退位请求，迫使后水尾天皇将皇位让了出来。
但家光当然不会就这么放纵胡闹的天皇继续染指政事。
鉴于两位皇子连续薨逝的前例，家光向京都御所派去了更多大奥女官及本丸武士，指示他们务必倾注全力守护幼帝。
接着，他立即将京都所司代重宗召到江户，并向重宗下达了多达十五条的指令，全力封堵后水尾天皇退位后涉及政事的所有可能。
家光下达的指令里，第一条到第三条是关于皇长女兴子即位一事，规定必须在两个月内完成。
对于退位后的后水尾上皇待遇，家光澹澹说了一句：“依他父亲后阳成上皇的旧例安排就好。”
虽然此时的江户幕府财力与武力已臻巅峰，但在家光指示下，后水尾天皇只领到三千石待遇。
同时，家光将当年朝廷在“御政”方面的预算限定在一万石，算作对公卿们先礼后兵的警告。
“重宗，要记得监控后水尾上皇处供职的公家人数，务必与他父亲后阳成上皇的旧例相同。”
“此外，你的另一项重要任务便是督促公卿们勤勉于学问，这样才能防止他们再生是非之心。”
“但最好的做法，便是让他们相互监督、相互检举揭发。所以重宗你还得要求他们向幕府报告无规无矩之人，但凡报告并核实者将予以重奖！”
受到家光指导之后，重宗觉得自己在压制朝廷方面的思维几近获得了全新启发，他对家光确实佩服得堪称五体投地。
但在指导重宗如何限制并打压朝廷的谈话过程里，家光又被启发出多重设想，他在政事方面的谋略与敏锐度，真可谓是无穷无尽。
“对了，重宗。你回去记得还要确保一点，那就是朝廷若要对包括诸位大名在内的武家进行官位颁授，都必须符合得到幕府推举的前提。”
“是！敢问将军大人，如若有公卿违反规则的话……”
“那就予以重罚！视之轻重处以褫夺官位、没收府邸和财产等责罚，不然他们怎么会害怕？”
家光的强硬姿态给重宗留下深刻印象，他的铁腕风格更明确增强了重宗在监管尺度上的信心。
这些先发制人的种种举措，蕴含了家光全力阻止后水尾上皇意图继续影响政事的坚定信念。
重宗正是感受到了这份信念，返回京都后随即大展拳脚，使家光的决策在京都得以全面落实。
朝廷在这重重压力下节节败退。
年仅七岁的皇长女兴子如家光所指示般，在后水尾天皇退位的两个月后继承了皇位，是为明正天皇。
女帝继位前，家光将重臣土井利胜与酒井忠世召到私人居所的中奥大厅，在茶叙中发出感叹。
“这可是自奈良时代的称德天皇后，日本时隔八百五十九年，再度出现女帝的特例呀，我们算不算创造了历史呢？”
土井对此显然深表认同：“虽然没能迎来皇子即位的盛况，但由女帝执掌朝廷也远比后水尾天皇要省心很多，推动这一切的将军大人当然是在创造历史了。”
“呃，土井你这是发自内心的夸赞、还是单纯为了让我高兴才接口而出的奉承话呢？”
“莫非将军大人认为以你今日的功绩与能力，还需要我这老臣的几句奉承话么？”
家光问得随意，土井亦答得老到与巧妙，两人对视了一眼，便都默契地哈哈大笑起来。
受到他们开怀大笑的氛围渲染，一旁的酒井也咧开嘴尽兴而笑。
君臣三人之间这种放松畅谈的相处方式，向来都是家光俘获幕臣忠心的秘诀之一。
在澹澹茶香间，家光针对女帝继位悉心拟定的指令和安排，陆续被指派给了两名老中。
“对了，关于这次女帝的继位仪式，我准备委任你们俩作为上使代表幕府前往京都参加。”
“只有我和土井大人吗？”酒井闻之吃了一惊，“我还记得后水尾天皇即位时，东照大权现大人可是亲自上京庆贺，仅由我和土井大人参加继位仪式会否低调了些？”
“要的就是低调。”家光将茶碗举到面前，小尝了一口后，对着酒井眨了眨眼睛，“毕竟现在幕府与朝廷的上下关系已经变得明确。”
他以调笑口吻回应了酒井后，迅即又调整回洽谈政事的正经语气，补充式地进行了解答。
“还有另一个原因在于，我们必须考量到对朝廷而言德川氏始终是外戚，所以我希望尽量避免公卿们批判明正天皇即位是德川一族强行推动的结果。”
家光的细致解答令酒井大为信服，他的驭臣之道比起父亲秀忠，无疑更得属下的重臣爱戴。
他从不仅止于单纯地向幕臣们下达指令，而会详细向他们解释及剖析自己这么做的动机、及可能会收到的效果。
这种被当成伙伴般对等交流的感觉，在这个时代极为罕有，然而从现代世界穿越而至的家光，却在担任三代将军时推动了让幕臣们耳目一新的议政体验。
土井和酒井两人就此奉家光之令上京。
在女帝即位典礼后的第三天，两人便与高僧崇传、京都所司代重宗在施药院进行了秘谈。
【注·施药院：古代日本佛教施药救济贫穷病人的院所，相传系圣德太子始创于四天王寺内。】
他们还请来在阿福参见天皇一事里发挥了极大作用的三条西实条、以及就任后水尾上皇身边“院执权”官职的中御门宣衡，向两名公卿传达了家光的旨意。
“将军大人的意思，是希望后水尾上皇批准罢免中院通村的武家传奏一职，改由三条西实条大人担任武家传奏的主力、担任公武两家交流的桥梁。”
土井严厉地向中御门宣衡强调，从表情到语气都没给后水尾上皇留下任何一丝的可商榷余地。
当天，后水尾上皇作出回复称“全凭武家处置”。
罢免中院通村、并改由三条西实条担任武家传奏主力一事，就此按照家光意愿强力落实。
后水尾天皇的突然退位，起初确实令幕府大感意外和慌乱，但很快幕府就在家光的带领下抓住这次机会，对朝廷进行了强有力的反攻与掣肘。
家光不但加大了对朝廷政事与后水尾上皇行动的限制力度，还将不尊重幕府的武家传奏中院通村罢免，将亲幕府派的三条西实条扶植为主力，进一步确立了幕府对武家官位的垄断。
后水尾天皇的突然退位，起初确实令幕府大感意外和慌乱，但很快幕府就在家光的带领下抓住这次机会，对朝廷进行了强有力的反攻与掣肘。
家光不但加大了对朝廷政事与后水尾上皇行动的限制力度，还将不尊重幕府的武家传奏中院通村罢免，换上亲幕府派的三条西实条，进一步确立了幕府对武家官位的垄断。
这场由家光独自策划及领军，向朝廷及后水尾天皇发动的进击，以大获全胜划下漂亮句点，他的运筹帷幄也令秀忠大感欣慰。
于是家光意识到，在自己声势与威望都立于高峰之际，是时候出手收拾暗藏祸心的忠长了。
忠长就像一座休眠的火山，虽然看起来仍陷于一片平和宁静，但始终是个不稳定的危险因素，随时都可能爆发。
一直在等待时机铲除祸害的家光，终于在连续创下一系列亮眼的幕政佳绩后，以秀忠为突破口，向忠长正式挥动了重击之剑！