在这场突然爆发的战斗中，黄超分为无数心神在不同地方战斗。
张浩所在的三艘顶级攻击舰接到的黄超的讯息。他出现在他们的显示屏上：“穿越战线，立刻向机械城市进发。”
在大战场中，有三艘攻击舰脱离了序列，笔直冲入了乌贼群中，上面的人提心吊胆，然而什么都没有发生。他们融入了机械怪物的军团中，乌贼给他们让开了道路。
黄超做的很简单，把这三艘船识别为友军。
黄超一把掐死了一个特工，他在他手上抽搐两下，彻底死掉了，化为数据碎片消失。与此同时，附近一座小山山顶突然爆炸，爆炸看起来不严重，可是这周围的区域都有种失真现象。
“好，去下一刻地方。”黄超飞身而起，前往另一个矩阵节点。在他身后的丘陵中，不是有爆炸的火光传来。这个地区的特工都被他彻底杀死，这些人干活也能快一点。
黄超的意识联入上千只组成集团冲锋的乌贼，一个停滞的命令发出，让它们面前失去电磁脉冲的飞机离开。下一刻，新的袭击者已经来到，轰，滋滋，电磁脉冲席卷了这一整团乌贼。
回航的飞行器落下，人们与自己的队友相拥庆祝，同时搭在新的电磁脉冲准备再次出发。
“就好像老天爷在保佑我，眼看乌贼要冲到我前面，他们动作一颤，又滑倒两边去了。不知道他们是怎么搞掉了乌贼的指挥中心啊。”人们互相说着自己的幸运遭遇，让战争看起来也不那么恐惧。
幸运的事情有很多，但如果每个人都能从脉冲攻击后平安返回，那就不只是幸运了。基地中的黄超接到指挥官王杰的询问：“每一次乌贼都让开了人类，我们到现在还没人伤亡。所有的那些巧合，都是你做的？”
黄超笑道：“应该是老天保佑吧。”
王杰沉默了，良久说道：“我一直觉得锡安被救世主的谎言欺骗很可笑，但是现在我开始相信了。真让人高兴，救世主也是我们自己人。”
黄超和墨菲斯等人按照计划炸了电站，进入通往万物起源的大楼，钥匙人给他们打开了一扇通往后门走廊的门。
墨菲斯一脸严肃，当先走入洁白的走廊，黄超也是表情淡然地走了进去，一点没有惊讶。
虽然他现在在另一边正好碰到了先知。
另一边的黄超狰狞一笑，与史密斯分毫不差，对拦在他面前的先知说道：“终于我见到了传奇人物先知，真是令人高兴的相会。你不是一直在躲避我吗，是什么让你敢站到我面前？”
史密斯黄超是一条战线，而这里又有许多个史密斯黄超，他们现在还是保持着特工史密斯的相貌，学着他嚣张欠揍的说话方式。
先知没有怀疑，两个人互相嘲讽几句，先知说道：“动手吧。”
黄超知道先知其实是故意送死，她被史密斯感染根本不会死，史密斯会变强大，造物主无法控制，只能和尼奥妥协，答应不再消灭锡安。尼奥到时候会牺牲自己挽救矩阵，而先知成为最大赢家。矩阵、机器人、智能程序从此将按她的路线来发展，她也帮助了人类，还可以释放“不想待在”矩阵中的人。
黄超把手插进了先知的手腕里，黑泥涌出，覆盖了先知，她变成了另一个史密斯。在矩阵深处，战斗才刚刚开始。所有的黄超意识，在这一霎那都有了停顿，先知在矩阵深处有着极为复杂的布置。
矩阵越混乱，黄超精神世界覆盖的越多，直到现在，造物主和先知都还以为这是时空的程序史密斯。
在走廊中，黄超有片刻的失神。墨菲斯听到他停下脚步，回头疑惑问道：“尼奥，你还好吧。”黄超露出一个让人放心的笑容：“没事。”
他们继续前进，走廊中没有人拦路，三人顺利进入了走廊尽头。
钥匙人从脖子上摘下一把钥匙递给黄超：“这是属于你的，你知道是哪扇门。”他又指向另外一扇门，对墨菲斯说道：“墨菲斯，那扇门，会带你回家。”
黄超站在门前，在编码的视野中，这扇门散发着不寻常的光芒。黄超墨镜下的眼睛闪过一丝笑意，他把钥匙插进门把手，缓缓拧动。从门缝中射出来白炽光芒，最后将他完全吞没。
黄超来到了一个周围全是显示屏的空间，在他面前一个原本背对他的办公椅转过来，上面坐着一个白色西装老头。
“你好，尼奥。”
“对不起，你认错人了。”黄超平淡地说道。
机械大帝计算了黄超回答可能，一一显示在周围的屏幕中，就为了给黄超心理压力。但是他竟然没有显示出这个回答！因为这回答概率太小，而房间墙壁显示器有限。
“原谅我，你在说什么？”造物主，也就是机械大帝，他已经操作过五次“救世主事件”，还从来没想到，救世主竟然会在他面前这么说。
“我是造物主，我建造了矩阵。”他不给黄超回答的机会，直接介绍起自己，想以此掌握谈话的主动。他正要往下说，黄超却举起了一只手：“原谅我打断你的话，这一切我都知道了。你好，我是黄超。”
自从机械大帝建造了人类电池梯田，每隔二三十年就会出现严重问题，这恰好是一代人成长的时间，每一轮都会有人觉醒特殊的力量。觉醒者总是尼奥那个年龄段的年轻人，带着叛逆思想的年轻人。这是矩阵融合人类精神力造成的异常因素，也可以看作机械大帝没有气运、注定被推翻的预兆。
机械大帝为此建立了锡安，引导这种异常因素，让他最后被迫牺牲自我，回归万物之源，把他从矩阵中带走的编码送回来。锡安就是专门为了在这种时候威胁救世主。
每一次锡安人都会被杀光，机械大帝会按照承诺，派出二十三个人重建锡安。然后就是一轮新的谎言，机械大帝想给人类编造经历很简单，只是一个小虚拟世界，他会释放里面的人，那些人会被安置到锡安，他们会以为自己战斗了很多年……
过个二三十年，新的异常就会发生了。